Dans le Japon des années 60, Umi est une jeune lycéenne dont le père a disparu en mer plusieurs années plus tôt. Elle vit avec ses trois petites sœurs dans une vieille bâtisse délabrée au sommet d'une colline qui surplombe le port de Yokohama.
Tous les matins, elle hisse deux drapeaux face à la mer comme un message lancé à l'horizon. Au lycée, elle se lie avec Shun, le responsable d'un club de journalisme, qui est impliqué dans un conflit étudiant sur le point d'éclater.

Une émouvante histoire d'amitié, d'amour et d'espoir qui prend un tour inattendu lorsque Umi et Shun découvrent un secret qui entoure leur naissance et semble les lier.